在使用消毒劑過程中，必須嚴格按照說明使用。由于消毒劑其本身就是一種危險品，故不可過度使用。如過氧乙酸是一種強氧化劑，各種微生物對其十分敏感，可將所有微生物殺滅。但因其氧化能力強，高濃度時可刺激、損害皮膚黏膜，腐蝕物品。同時，長期大量使用消毒劑、滅菌劑，會使微生物產生抗藥性，滅菌效果大大降低。

日常生活中常用的消毒劑主要有含氯消毒劑，比如大家熟知的84消毒液，這種產品在超市就可以買到，可以用來消毒餐具、桌椅、廁所潔具等物品。一般情況下，居室空氣無需使用專門的消毒劑消毒，通風換氣是保證居室空氣衛生質量的重要措施。確實需要用消毒劑進行殺菌、消毒時，可選擇一定濃度的過氧乙酸或過氧化氫噴霧消毒，也可選擇臭氧空氣消毒機，消毒后還要通風換氣。

在使用消毒劑前，必須徹底清除環境中存在的有機物，如糞便、飼料殘渣、畜禽分泌物、體表脫落物，以及鼠糞、污水或其它污物。因為這些有機物中藏匿有大量病原微生物；這會消耗或中和消毒劑的有效成分，嚴重降低了對病原微生物的作用濃度。

同時為了避免消毒譜不廣，防止致病菌產生耐藥性，須輪換使用消毒劑。 ^[1]